中心的基本职责是：疾病预防与控制；突发公共卫生事件应急处置；疫情及健康相关因素信息管理；健康危害因素监测与干预；实验室检测检验与评价；健康教育与健康促进；技术管理与应用研究指导。

中心拥有理化实验室、微生物实验室、百级洁净实验室、万级洁净实验室、二级生物实验室（PⅡ实验室），拥有原子吸收光谱、气相色谱、液相色谱、PCR仪、流式细胞仪、网络服务器等近2000万元的仪器设备，通过省级计量认证，取得了职业卫生技术服务机构资质，取得国家级HIV抗体确认实验室资格，国家霍乱实验室、碘缺乏病实验室、流感网络实验室，能开展理化、微生物学、血清学、病毒载量、CD4、霍乱毒力基因和分子生物学等方面的检测检验；提供食品卫生、环境卫生、职业卫生、化妆品、生活用水及涉水产品、消毒产品、一次性卫生用品、其他化学品、疾病防治方面等各种检测检验、评价和技术仲裁服务及卫生毒理学研究。
中心的工作得到了各级领导的重视和政策的支持，市委、市政府、市人大、市政协和市卫生局领导多次莅临中心视察、调研，现场办公解决全市疾控工作中的实际问题。
改革开放以来，尤其是近年来，中心坚持“预防为主”的方针，在全体疾控人员的共同努力下，卫生防病工作硕果累累、成就辉煌。各种传染病总发病率由1977年的2566.26/10万降至2008年的203.09/10万，对突如其来的非典和人禽流感、手足口病疫情，果断采取了强有力的科学的综合防治措施，有效的防止了疫情在我市的发生和流行；霍乱发病率控制为零；艾滋病防治衡阳模式显实效；职业病防治有序开展；2008年5月12日汶川特大地震后，中心派出三批卫生防疫队奔赴灾区，开展抗震救灾卫生防疫工作。先后获得“全国计划免疫先进单位”、“全国尘肺流调先进单位”、“湖南省霍乱防治工作先进单位”、“湖南省结核病防治工作先进单位”、“湖南省防治非典先进单位”、“市先进基层党组织”、“市卫生系统先进基层党组织”、“市三星级文明单位”“市计生工作先进单位”等多项荣誉和奖励。